“我对普通的人类没有兴趣。你们之中要是有外星人、未来人、异世界来的人、超能力者，就尽管来找我吧！以上。”这位就是在开学的自我介绍中，发言惊爆的凉宫春日。对于平淡无聊的日常生活无法忍受的她，创立了一个不可思议的社团——让世界变得更热闹的凉宫春日的团，通称SOS团。 虽然同班同学阿虚、寡言读书少女长门有希、萌萌学姐朝比奈实玖瑠、神秘转校生古泉一树等人都被她牵扯进来，但是阿虚以外的三人却有着凉宫春日不知道的大秘密。
“秘密结社如月”眼见征服世界的目标即将实现，为了扩大版图，将战斗员六号作为先遣部队派遣至新侵略地，但他的各种行动却让干部们伤透脑筋。
自从小时候母亲去世以来，就封锁了心灵的真。 一直守护在他身旁的，青梅竹马琴莉。 高中三年级的现在，就在终于准备跨出一步的两人面前， 来自另一个日本的，另一个“我”突然出现——。
人世间存在着大大小小的谜团，当这些谜团被解开之时会释放出或强或弱的能量，食脑奈罗（子安武人 配音）就是专门食用这些能量的魔族，当魔界再无可以解开的谜团之后，他来到了人世，只为了寻找那能够满足他的极致的谜团。 桂木弥子（植田佳奈 配音）是一名拥有着悲惨过去的高中女生，她的父亲死于非命，然而凶手至今未被找到。命运让充满了谜团的弥子和憧憬着谜团的奈罗相遇了，在奈罗的帮助下，弥子终于解开了事件的真相。之后，奈罗和弥子开设了魔界侦探事务所，弥子虽为名誉上的所长，但真正运转侦探社，解开谜题的却是拥有着恐怖魔人力量的奈罗，两人联手解开了一系列匪夷所思的案件，使得黑暗的人性在光天化日之下无处遁形。
本片讲述了少年禹背负拯救人类的预言使命，努力寻找自身神力的故事。作品旨在营造上古时代的神话世界，塑造了一个自强不息精神的少年英雄，最终获得了族人们的拥戴。
