云玛集团总裁卫卿和美术系毕业生周是这对正在经历异国恋的情侣因为彼此的信任危机而分手。两年后的周是重新回到卫卿的世界中却与过去大不相同，为了重新挽回周是，卫卿想尽了一切办法，两个人从最初的的矛盾重重到最终的冰释前嫌，一路上的磨难让两个人再一次看清了对方的心意，也更加确定了对彼此的感情，两个人的关系变得更加坚固。而周是的两个好朋友，也在各自的成长中有了新的收获。女神林菲菲和艺术家甯非的相处更加甜蜜，学神毕秋静和学霸李明成也成为了幸福的三口之家。
卫斯理为唤醒昏迷的爱人白素,求助于拥有着超凡能力的蓝血星人方天涯。方天涯在三百年前的一次意外中坠落地球,当时和她一起的还有他的爱人洛卡,两人失散。三百年间，方天涯一刻也没有放弃过寻找爱人。作为回报，卫斯理答应帮助她寻找洛卡。 在寻找过程中，卫斯理面对同甘共苦的知心爱人白素，和与其有着莫名情愫的方天涯，陷入了两难境地。
A国政府在联合国毒品控制局的帮助下，军警联合，制定出扫毒计划，但无法得到海洛因提炼工厂的准确位置，扫毒计划难以成功。联合国毒品控制局琼马斯上校，前来中国求援。我国政府为尽国际义务，派侦察员林永生，利用他与陈莉英的母子关系进入“金三角”与毒枭展开了一场惊心动魄，曲折离奇的殊死斗争，最终夺得提炼海洛因秘密工厂的准确位置情报该剧有悲欢离合的母子情、情意缠绵的少女恋、阴险狠毒的无情残杀，鲜为人知的“金三角”风土人情和莽莽林海中的疯狂生活跌宕起伏，扣人心弦。
解放军某部侦察参谋赵常胜乔装智入李匪盘踞的华阴县城，通知起义部队提前举行起义，解放了华阴县城。敌旅长李继龙率残部逃往华山。途中李匪假冒“解放军首长”劫持华山镇美女杨玉环未果，用中正剑杀死杨玉环的义兄。杨玉环欲为父报仇。李匪逃上华山，封锁华山通道，以杀害数百人质和毁坏华山文物古迹要挟我军。为消灭李匪、解救人质、保护华山珍贵文物古迹，我军派遣信使张正道和孟习圃携劝降信上山劝降。张正道被李匪杀害，孟习圃逃回部队，加入赵常胜的侦察班，寻找第二条登山路。在樵夫王拴娃和段成群的协助下，侦察班攀悬崖，越深渊，奇取了北峰。侦察班与李匪斗智斗勇，解救了被扣为人质的数百百姓，保全了华山文物古迹，配合大部队解放了整座华山。
张漾（郑凯 饰）和李珥（米咪 饰）之间的感情最终还是以分手告终，之后，稍稍平复了心绪的李珥来到了天中，成为了那里的一名老师。李珥不拘小节大大咧咧的作风吸引了男生段柏文（陈哲远 饰）的注意，在他的内心里播种下了懵懂的种子。 于池子（李兰迪 饰）是段柏文青梅竹马的好友，然而，她对后者的感情早就已经超越了友谊，只是于池子选择将这份爱恋深深的埋藏在心底。一次偶然之中，于池子发现自己最好的朋友斯嘉丽（余芷慧 饰）和段柏文之间似乎有着说不清道不明的关系。愤怒和绝望之中，深感遭到背叛的于池子决定向斯嘉丽复仇，让她也尝一尝痛苦的滋味。
舒城在楚墨两国之战中落败,因为种种原因成为了墨国五皇女莫茴的魂器,失去自我意识的舒城跟随姐姐莫茹回到墨国,面对失而复得的妹妹,莫茹欣喜又忧虑,为了保护亲人和国家她弃医从戎、不断压抑和牺牲自我,甚至为了保护莫茴不惜被砍掉一条手臂,然而山雨欲来风满楼、这一切仿佛都阻挡不了局势的动荡不安。
20世纪初的上海，留法归来的同窗仼天翔（陈勋奇 饰）、何非凡（刘锡明 饰）结识进步报人钟学仁（陆鸣书 饰），钟力邀他俩加盟，不料杀手突然杀死钟学仁，仼、何被当成疑凶被捕入狱。身为商界名流的何父（姫麒麟 饰）很快将儿子接出狱中，历经层层周折，仼天翔也回到阔别多年的家中。由于家庭出身不同，人生观自然也不同。加盟《先锋日报》后，仼天翔本着报人的良心深入最底层采访，加上何非凡的小说连载，该报一夜之间成了上海滩新闻界的龙头老大。后来，俩人的世界观走向了两极，一个用手中的笔作为针砭时弊的武器为民呼吁，另一个则迎合陈腐的花花世界违心粉饰太平。志不同则道不合，当年的同窗好友最终游离在亦正亦邪、黑白不分的漩涡之中......
本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除了史可、李婷、刘冠军等几位观众熟悉的演员外，大多数演员都是新面孔。
