故事发生在清朝康熙末年。野心勃勃的四阿哥（万梓良 饰）在年羹尧（杨泽霖 饰）的支持之下谋权篡位，更改传位昭书，残害手足，最终顺利坐上了皇帝的宝座，将称号改为了雍正。在夺嫡之战中落败的十四阿哥（伍卫国 饰）虽然有着大内高手曾静（姜大卫 饰）的贴身保护，却也只能隐姓埋名踏上逃亡的旅途。 最终，十四阿哥还是得知了皇阿玛的死是四阿哥设计所为，心中又惊又气的他发誓要替父亲报仇雪恨。雍正和曾静同时喜欢上了名为吕四娘（米雪 饰）的女子，这段三角恋情让曾静和十四阿哥的境地变得更加危险起来。
司马信（马国明 饰）为人吊儿郞当，更非常沉迷三国onlinegame。由于“诸葛亮”使他在三国online游戏界享负盛名，因此司马信一直视真正的“诸葛亮”为偶像。因为被诬陷藏毒，司马信被警方追捕至龙鼓滩。适逢一个五百年一遇的超强台风“鲨鱼”正逐渐迫近香港，黄道十二宫快要连成一线。司马信狼狈之下误岔错脚，就此跌入时光隧道…… 时光隧道的另一边，正是他日夜沉迷作战的三国时代，他更误打误撞来到诸葛亮（林峰 饰）隐居的卧龙村！期间又巧遇刘备（李国麟 饰）、张飞（曾伟权 饰）和周瑜（陈展鹏 饰）等各路经典人物。凭现代蛊惑怪招与偶像斗智斗力，令本来在现实生活一事无成的司马信突然脱胎换骨，亲身经历了一幕幕耳熟能详的三国历史场景，在临别秋波之前更与宫女桑柔（杨怡 饰）发生一夜情…… 到底君子式的忠孝仁义还是香港仔耍滑头是取胜之道，一个充满惊喜的新三国时代即将来临……
某日，日进收到一个自称Mary的求助电邮，关乎一宗离奇的凶杀案。Mary那无助、孤独、绝望的声音，令日进伸出援手，经过几次接通不良的联络，最后终相约在咖啡店见面。 热闹的咖啡店，二人依时应约，虽然坐在相同的位置，却找不著对方，最后接上视像电话，在同一间店同一张梳化，二人却身处不同的时间。更奇怪的是Mary的样貌竟然与可岚一模一样，但神韵气质却大相径庭…
以明朝为时代背景，描述李其(朱江)，练得一手好剑，因生活十分困苦，加上妻子沈素心(曾庆瑜)体弱多病，为生活沦为盗贼。由于他剑术高明强，渐渐声名大噪，后来做了一宗大买卖，被官府追缉，更被同伴出卖，被名捕头设下陷阱捕获，被重判配刺发放边强。李其深省悔悟，适逢新帝大赦，放其还乡。李其满意以为可以重新过日子，谁知昔日出卖他的同伴，因恐怕其复仇，沿途加以陷害及追杀，加上他面上有刺青字，被人唾弃。虽然一家三口重聚，仍过着提心吊胆、颠沛流离的逃亡生活……
故事发生在明朝年间，李寻欢（关礼杰 饰）因为身怀绝技而受到江湖中人的敬仰，渴望自由自在不受束缚的生活的他却往往因为一副侠肝义胆而身陷麻烦的漩涡之中无法自拔。李寻欢深深的爱着林诗音（关宝慧 饰），却因为一场意外的发生将爱人托付给了好兄弟龙啸云（陈捷文 饰），就这样，林诗音成为了龙啸云的妻子。 情路的坎坷让李寻欢选择了放浪形骸的生活，在此期间，他结识了古灵精怪的孙小红（黄小燕 饰）和正直勇敢的阿飞（钱嘉乐 饰），三人之间结下了极为真挚的情谊。让李寻欢没有想到的是，自己深深信赖的龙啸云竟然企图对他栽赃陷害，不仅如此，龙啸云和林诗音的儿子龙天赐（邓兆尊 饰）也将李寻欢视为仇敌。
黄英姑（薛家燕）生性乐观，与女儿孙敏华（汪琳）等一家人自给自足。英与邻居王志祥（许绍雄）交情甚笃，其子王剑（吴启华）更把英当作再生母亲看待。时下的香港贪污盛行，在摊档工作的英因欠债，偶然会替人当替死鬼做偿还，坐数日监。一次，英不知就里，便一口气答应当替死鬼，结果被人屈成杀人犯，判以死刑。英行刑剪下辫子，吩咐当狱警的祥将之交给华做纪念。英死后冤魂附在辫子上，却因辫子落在装有关公像的证物房里无法出来，一困十数年…… 转眼间剑已长大成人，当上警察，正直的剑因不愿贪污而只能负责看守证物房。剑在证物房翻出英的辫子，二人终相认。当年驾祸给英的叶家声（张兆辉）升做探长，把关公像重新移位，英冤魂得以重获自由。英挂念华，剑积极助她寻找华的下落；而剑亦得英的帮助而屡破奇案，许是宿命使然，英找到了华，却发现华如她一样被屈做替死鬼……
嘉庆年间，皇上与皇后前往热河行宫避暑，并许诺归来后将于中秋佳节之季晋如妃（邓萃雯饰）为贵妃。然而此时宫外却疯传对如妃不利的传言，靠在宫中打听消息取利的撷芳殿奶娘湘菱（蔡少芬 饰）和公公马新满（韦家雄 饰）等人亦卷入其中。而这一切却是如妃的妹妹，也就是年少守寡的淳太妃（伍咏薇 饰）所为。如妃听之任之，只愿有朝一日能解开心结。并暗中笼络亲生孩儿五阿哥的奶娘湘菱和太医杨梓轩（曹永廉 饰）一齐照顾五阿哥，以保守钮祜禄一族的秘密。为讨淳太妃欢心，如妃要求南府在戏单上加唱一曲《牡丹亭》。手忙脚乱之际，公公马新满只得让在府中教戏的章和班代为上台。却不料京中名伶高流斐（陈豪 饰）一唱成名，宫中女子多芳心暗许，如一粒石子投入紫禁城平静的湖心。 本剧为《金枝欲孽》第二部，讲述另一个时空的后宫风云。
少年剑客飞(黄元申)一心想扬名天下，机缘巧合，与被誉为「小李飞刀，例不虚发」的李寻欢(朱江)成为莫逆之交。欢因误伤义兄龙啸云之子，重遇阔别廿年的龙和已成为龙妻的旧情人林诗音(李琳琳)。时梅花盗重现江湖，掀起一片腥风血雨。龙为恐欢、音二人旧情复炽，诬害欢为梅花盗，飞为救好友，独闯龙潭，惜不敌，更受重伤，幸得天下第一美人林仙儿(黄杏秀)相救，并对仙之美貌倾心。 欢在少林受公审，飞为替欢洗脱罪名，冒梅花盗之名犯案却失手就擒。众以飞要挟欢就范，欢幸得高僧相助，揭破少林经书失窃之谜，少林方丈遂让二人下山，侦查梅花盗之真正身分。飞竟发现仙就是梅花盗。仙被欢揭穿身分后，与飞音讯全无。
大唐中宗景龙年间，两大名捕裴逸飞（吴镇宇）、淳于子鸿（戴志伟）及神医宋轩（甘国卫）本乃好友，三人同时爱上酒馆女主人麦菊儿（梁佩玲），而菊儿独钟情于逸飞，宋轩知难而退，与寡妇慕兰（张凤妮）展开另一段恋情。但子鸿却不忿，加上事业有所不及，为击败逸飞，而误入魔道。女线人上官晶晶（林其欣）暗恋逸飞，惜襄王无梦，晶晶失意之余，机缘巧合之下与微服出游的李隆基（杨得时）结识。韦后（李丽丽）夺权，毒杀皇帝，把持朝政，子鸿助纣为虐，隆基则得晶晶、逸飞及胡姬（郑艳丽）相助，与韦后对抗，连场明争暗斗，隆基终败韦后，力保大唐江山。子鸿失去靠山，转而加入金魔王（叶天行）之幽灵帮，继续对付逸飞，并杀死宋轩，逸飞悲痛欲绝，加上其妹裴凌（姚正菁）亦间接死于子鸿之手，逸飞誓杀子鸿报仇。此时，逸飞却查出菊儿竟是幽灵帮一份子，其真正身份是……
邪派魔头宣慈一心想夺取天师府的至宝，率领手下进攻天师府，导致张天师受伤后逃离。宣慈派出三大杀手追击张天师。林楚燕是地方官林浩然的独生女，她从奶妈胡大婶那里学得一些小法术，能够在酒后施展阴阳眼，察觉到鬼魅的存在。林浩然是文官，而司徒镇业则是武官，两人相互勾结以敛财，为了避免猜忌，他们决定撮合他们的子女成婚。林楚燕对司徒文武有着深厚的感情，两人最终结为夫妻。然而，命运捉弄人，他们的成婚之夜楚燕因误饮交杯酒，看见了不应该看到的事物，导致误伤了婆婆，最终被休去妻子的地位。 尽管楚燕私下暗恋丈夫，她尽管生性高傲，内心却充满不甘，仍然不顾万里艰辛，寻找文武，希望能够挽回他的心。张天师发现司徒文武是七星脚，是修道的奇才，便收他为徒。张天师了解到楚燕的心思，决定帮助他们重新走到一起。在一个小镇上，文武遇见了戏班花旦凝凤，对她一见倾心。然而，戏班中的文生金玉棠也对凝凤展开了追求，却无意中发现她实际上是魔教的杀手人凤，并最终被杀害灭口。人凤对文武动了真情，但却因宣慈的命令要杀死文武，幸好张天师和楚燕及时赶到，最终人凤被张天师所杀。尽管遭遇重重困难，文武依然执迷不悟，愤然离去。
督察袁金昌（欧阳震华 饰）和电视女主播杨夕雪（关咏荷 饰）相恋多年，在一次办案中，袁金昌误杀恋人夕雪，无限悔恨的他灵魂出窍，穿越时空，现身于宋朝，摇身一变成了包青天。他运用现代知识，与开封六子屡破奇案。不久，他遇到一个叫韩霜霜的女子，惊讶地发现她与夕雪长得一模一样。可惜霜霜生性冷傲，且遗忘了前世所有记忆。不过，二人在查案过程中渐渐互生情愫。然而这一世注定悲剧收尾，霜霜再次死于他手中。苦痛中他再次穿越时空，来到了50年代的香港，再次遇到了与夕雪长得一样的女子，二人命运再度缠绕，这一世，是缘分还是劫数…… 三段时空，三世情缘。宿命能否逆转，有情人能否终成眷属？
少林寺乃江湖武术宗师所在地，清朝政府欲统一天下，视少林为大患，设法去铲除它。 清政府藉天地会首脑陈近南藏身少林寺，趁机派大量官兵及高手消灭少林，寺内僧人四散，少林寺毁于火海。至善禅师自焚之前，嘱咐俗家弟子洪熙官及方世玉一定要重建少林寺。 洪、方二人访寻昔日同门胡惠乾，欲暗杀少林叛徒高进忠以报仇，惜事败，世玉被白眉所伤，幸获两广总督曾必正之女曾玉媛所救。方、媛并暗订终生。 乾隆微服南巡，偶然下遇见玉媛，被其美貌所吸引，决定封媛为贵妃，但此时玉媛已怀有方之骨肉，媛父恐招惹灭门之祸，狠心杀女并嫁祸方世玉。 方世玉知悉玉媛身亡，屡次行刺乾隆，不遂，终被杀。 另一方面，胡惠乾为复兴少林，舍恬静生活前往报仇，失手逃亡。其妻王婉冰于危难中诞下麟儿，取名文定，幸得洪熙官照顾，胡一家团聚。 高进忠看上婉冰，故意折磨惠乾，胁迫冰下嫁。洞房之夜，婉冰趁进忠宿醉未醒欲杀之，惜事败，反被进忠一刀刺死。 婉冰香消玉殒，惠乾誓要报此血海深仇，后逃入京城，躲于敖坤府中为仆。惠乾利用高进忠、敖坤、曾必正的矛盾，使敖坤被斩。惜惠乾最终也性命不保，临终前托熙官抚养儿子文定。 洪熙官隐姓埋名，并将少林的虎鹤双形拳改良成功，成为民间易于掌握的洪拳，而文定也长大了。 十二年后，洪熙官乘开武馆之便，带文定到广州拜猴拳云四为师，并告以身世。文定从此努力练武。洪与文定连手，击毙高进忠和白眉。又击退众武师，替乾隆立功。乾隆最终允许洪的请求，重建少林。而洪拳、猴拳两家之长，均集中在胡惠乾的遗孤，即洪文定身上。
