该剧改编自步月浅妆的小说《权宠之仵作医妃》，讲述大理寺卿沈毅因卷入晋王案，全家惨遭灭门，其女沈莞借用秦府九娘子秦莞的身份逃到荆州。原本柔弱可欺的秦莞“性情大变”，不仅会治病救人，还能剖尸探案，顺带将秦府的伯母庶妹姨娘刁奴治得服服帖帖。探案期间秦结识了睿王世子燕迟，燕迟一心为晋王翻案，与秦莞为父昭雪的目标不谋而合，二人一起回京，途中联手破获了各式诡谲大案。回京后，一具意外发现的骸骨让晋王案得以重提，燕迟和秦莞一起慢慢接近了案件的真相，发现了皇宫里深藏的惊天秘密。
故事从1978年讲起，陈福生（滕汝骏 饰）是一名电影放映员，育有一子名为陈焕（许亚军 饰）。干部林汉民（韩小磊 饰）是陈福生的邻居，而他的女儿林平平（原华 饰）和陈焕则是从小玩到大的青梅竹马。在文革中，林汉民蒙冤受罚，而品学兼优的林平平亦因为父亲的政治问题无缘理想中的大学，与此同时，陈焕被师范大学录取，两人从此渐行渐远。 之后，林汉民的冤屈遭到了平反，之后，林平平进入了北京大学深造，而她和陈焕之间的缘分亦遭受着种种考验。时间如流水一般静静流淌，在时代车轮飞速向前旋转的同时，陈家和林家，这些小人物的命运被迫裹挟在轮下，不断向前。
本剧讲述了在抗日战争最艰苦的岁月里，医生杨冠雨和副县长杜松山虽身在大后方却心系战局，支援前线，拯救民众，与大发国难财的腐败官僚进行斗争的故事。爱恨情仇、生死缠绵，热泪和鲜血锻造出伟大的人格。 全剧波澜迭起，人物鲜明，描绘出抗战大后方一幅耐人寻味的历史画卷。 1938年武汉失守，杨冠雨受国民政府委派，带着助手谢霖来到大后方玉城筹建伤兵医院，没想到玉城名医项鸿年在家中被人暗杀，由他掌管的伤兵医院巨额筹建款不翼而飞……抗日英雄副县长杜松山着手调查此案，耿直的杜松山与杨龃龉不断，却被杨发现颈椎中的残留弹片而急需手术……杜成了杨到玉城以后的第一个病人。杨冠雨与何雪珍邂逅，一见钟情，却不知何雪珍与杜松山早有婚约…… 为了揪出幕后黑手，杜与女共产党员方淑云演了一出苦肉计，那黑手其实就是玉城县县长骆元发，骆元发舍卒保车，县长助理老潘拒捕，被杜松山击毙。为此方淑云也付出了代价，被谴回原籍—已经沦陷了的武汉。杜为了解救方而向其求婚，而杨何也终成眷属，二对新人同日结婚，却遭遇日军空袭玉城……杨冠雨发现玉城的重重黑幕，为讨回医疗款与骆元发结仇。谢霖多年前曾受日本人引诱，签署过合作书，日本特务石原找上门来，威胁谢协助炸掉伤兵医院和炼铁厂，谢在最后的关头忏悔了，保住了伤兵医院，炼铁厂化为焦土，石原被俘自杀，谢精神几近崩溃，行踪被骆元发发现，骆利用谢的胆怯诬陷杨冠雨通敌叛国……回龙镇爆发鼠疫，杜立下生死状力保监狱中的杨冠雨出任疫情总指挥，几个月的奋战杨冠雨带着他的医疗队与死亡争分夺秒……就在制服鼠疫之时，骆派出的杀手已经悄然而至，方淑云为保护杨牺牲，留下遗腹子杜铁…… 岁月无痕，抗日战争已经经历了第八个年头，坚信“中国必败”的骆更加心狠手辣，而感情失意的谢霖也迁怒于杨，二人勾结起来，诬陷杨贩卖毒品，并设下圈套陷害何雪珍，杨为了保护何只得承担罪名。他坚守着医者的信念，却放弃了医生的尊严。何痛不欲生，选择了与骆同归于尽……远征军归来带来瘟疫，玉城岌岌可危，杜率军对峙一触即发，杨冠雨以人格的力量阻止了一场恶斗，杜为保护杨身中数枪，生死未卜……胜利的日子已经来临，杨冠雨在玉城的欢呼声中走向手术台，手术台上是他的兄弟、朋友、曾经的情敌、现在的战友—杜松山。
年轻女孩郝欢喜深受过世警察父亲郝仁影响，立志成为一名人民警察。警校四年，她与同学：游春风、裘美、叶雯、鲍栋建立了深厚的友谊。一次偶然的KTV试唱，欢喜等人卷入了一宗警方调查已久的贩毒案件，嫌疑人被抓获却暴毙狱中，线索中断。他们了解到：贩毒集团由代号君子兰的神秘人物控制。毕业后，欢喜等人入职警局，成为贩毒专案调查小组成员。在调查过程中欢喜发现父亲郝仁与该案有关，种种证据表明父亲是一名变节卧底，她精神奔溃跌入低谷。经领导和同事开导，欢喜重新振作，决心还父亲清白。经过众人的努力，君子兰被抓获，此人正是养育鲍栋成人的叔叔倪鲲，历时已久的贩毒案终于告破，证实郝仁清白。办案过程中的种种曲折、牺牲，让欢喜等人真正领悟到了人民警察使命和精神
一个能干的秘书和一个自恋的老板坠入爱河，同时揭开了一段不堪回首的往事，这让他们怀疑自己的感情是真实的还是共同创伤的结果。
九一八事变爆发，戍边家族顾家抵抗日军，惨遭灭门。顾家养女顾雪萤幸免于难，前往齐齐哈尔寻找未婚夫顾照龙。顾照龙卧底成为伪满军官，顾雪萤以为他已经叛国，为维护家规，决心杀死顾照龙。顾雪萤前往千山投奔抗日义勇军，并参加义勇军三打哈尔滨之役。后义勇军在共产党领导下改组为东北抗联 ，真正发挥出了战斗力。顾雪萤发现顾家的忠义信条，与共产党的纪律不谋而合。她在战场上数度与顾照龙相遇，却始终没能手刃对方。在一次次战斗中，顾雪萤与参谋沈雷志渐渐相爱。沈雷志被逮捕到新京，顾雪萤潜入营救，发现对手又是顾照龙。抗日战争接近尾声，已经得知真相的顾正雪被编入教导旅，与顾照龙一起打下了东宁要塞，顾照龙却……
顾川（任嘉伦 饰）曾经是一个乐观开朗的男孩，然而十年前，他因为一场车祸而身受重伤，不得不接受了心脏移植手术，自此之后，在他的胸腔里的跳动着的，是一枚冰冷的机械心脏。顾川也因此而彻底告别了情感波动，他不能有任何正常人应有的喜怒哀乐，过于强烈的情感对他来说意味着死亡。 一晃眼十年过去，顾川和好友许诚然（刘芮麟 饰）共同创立的建筑设计公司经营的顺风顺水，顾川也因此在业内有了名望，喜怒不形于色的他被不知情的人们戏称为“蜥蜴先生”。实际上，这样的生活让顾川感到非常的痛苦，他决定做完手上的最后一票，就结束自己的生命，在这个击鼓眼上，上帝将一个名为姜小宁（邢菲 饰）的女孩送到了他的身边。
解放战争后期，新B军司令沙秉章被调驻守丰城，而国民党保密局也将鲁敏芝调往丰城，她的首要任务就是调查沙秉章是否有投共的意图。山野洋子秘密来到丰城，她的目的是遵父山野诚一之命意欲执行一项BBURH行动，找到父亲遗留在丰城的细菌炸弹。齐中飞作为我党地下组织人员在沙秉章身边潜伏多年，沙秉章虽是抗日名将，却饱受国民党内部的猜疑。齐中飞一直观察沙秉章的一举一动，计划让沙秉章起义投共。而沙秉章在抗日战争时缴获的细菌炸弹，一直是他的秘密王牌。最终，沙秉章在深思熟虑之后率部起义，细菌炸弹也交给我军妥善处置。
