李时珍（林文龙 饰）自由沉迷于草药研究之中，他同名为吴慕榕（李诗韵 饰）的女子先前已有婚约，却无法自持的爱上了善良美丽的阿冬（叶璇 饰）。李时珍决定将这份感情埋藏在心底，待科举考试之后向阿冬表白心意，哪知道在阴差阳错之中，他不仅没能够表白，还娶了吴慕榕为妻。 李时珍发现当今世上的医书错误连连漏洞百出，于是起了编撰《本草纲目》的念头。然而，他却因为个性过于耿直而得罪了权贵，使得他不得不暂时中断了医书的编撰，还性命不保踏上了逃亡的旅途。所幸有太医院的庞宪（马国明 饰）一路帮助扶持，李时珍终于完成了旷世奇作《本草纲目》。
民初上海滩 群雄逐鹿 十里大洋场 仇杀不休 三十年代，叱吒上海黑道二十多年的聂进(苗侨伟)在妻子横死后退下战线，经营起小笼包店来，并出於歉疚而聘请了何水秀(向海岚)。进的退隐，叫一心跟随他的石世九(黄宗泽)失望不已。 进本没有打算重出江湖，但是当他知道黑帮兄弟胡大川可能跟妻子之死有关，并且眼看著其他兄弟逐一遇害时，他知道江湖事终究要以江湖手段来解决。 进和川因而展开了连场廝杀；然而其后一连串事件，叫进怀疑背后还有黑手。另方面，更叫他震惊的是，女儿曼华(杨思琦)的亲生父亲，原来竟是对他恩重如山的大亨顾长城(高雄)……
周大伟和小老婆叶艳凤（柳影虹 饰）收养了一名女婴，取名小红（陈松伶 饰）。然而，这一决定导致了周家的经济状况逐渐下滑。在艰难的岁月里，小红艰难成长。成年后，她有幸加入了明月社剧团，开始了她的歌唱生涯，并改艺名为周璇。在一次歌唱比赛中，她展现出了非凡的才华，开始崭露头角。 尽管璇受到了团员缘萍（何嘉丽 饰）的敌视，但她得到了严子华（黎明 饰）和张雪文（马海伦 饰）的支持和爱护。子华与周璇之间渐生情愫，经历了一系列波折后，最终他们结为夫妇。然而，周璇的契爷楼建中却只把她视为摇钱树，导致与子华之间频频发生冲突。建中设下奸计破坏了他们之间的感情，最终导致了子华和周璇的离异。周璇受到了巨大的打击，但在此时，她遇到了布匹行的少东罗浩德。罗浩德对周璇关怀备至，令她再次陷入情网中。
华裔女队长魏晓晨带领特警队，捣破人口贩卖集团基地，发现一具女性尸体，竟然是孪生妹妹梁曦，晓晨悲痛欲绝，发誓要用余生追查妹妹被杀真相。
故事发生在明朝年间，李寻欢（关礼杰 饰）因为身怀绝技而受到江湖中人的敬仰，渴望自由自在不受束缚的生活的他却往往因为一副侠肝义胆而身陷麻烦的漩涡之中无法自拔。李寻欢深深的爱着林诗音（关宝慧 饰），却因为一场意外的发生将爱人托付给了好兄弟龙啸云（陈捷文 饰），就这样，林诗音成为了龙啸云的妻子。 情路的坎坷让李寻欢选择了放浪形骸的生活，在此期间，他结识了古灵精怪的孙小红（黄小燕 饰）和正直勇敢的阿飞（钱嘉乐 饰），三人之间结下了极为真挚的情谊。让李寻欢没有想到的是，自己深深信赖的龙啸云竟然企图对他栽赃陷害，不仅如此，龙啸云和林诗音的儿子龙天赐（邓兆尊 饰）也将李寻欢视为仇敌。
本剧是一部描写现代家庭情感的电视剧，导演和主创人员皆为电视剧《红蜘蛛》的原班人马。每两集一个故事，通过对十个具有典型性的“问题家庭”的案例分析，向人们提出警示—该以怎样的态度面对家庭矛盾，以维持家庭的圆满，避免悲剧的发生，促进社会的安定团结。剧中通过十个家庭案件，揭示出个人内心的虚弱，描绘了人们由于情感错位引起的犯罪。导演将通过“情感十戒”向观众警示：每个人都应保持对生存的警戒，坚守生存规范。 该剧延续了《红蜘蛛》的纪实风格，并且加强了整体的艺术性。都晓介绍说，《家庭档案》不完全是纪实，但故事却力求真实，贴近老百姓的生活。为此，在演员的选择上剧组拒绝大腕加盟，选用一些实力很强的演员，除了史可、李婷、刘冠军等几位观众熟悉的演员外，大多数演员都是新面孔。
在第二部里，象牙山村中的年轻人们找到了各自事业的方向，不过他们的爱情却有一波三折。 王小蒙（王亚彬 饰）的豆腐厂上线，每天忙里忙外，不得清闲。谢永强（贺树峰 饰）则专注自己的果园，和小蒙几天都见不上一面。两个孩子忙事业始终推迟婚期，急坏永强的父亲谢广坤（唐鉴军 饰）；赵玉田（吴云飞 饰）和刘英（蒋依杉 饰）结婚后，开始忙于花圃的经营。来村中实习的女大学生陈艳南吸引了赵玉田的注意，刘英大吃其醋，无事忙刘能（王小利 饰）对女婿的做法也颇为不满；香秀（王君平 饰）迎来了新同事王天来（小沈阳 饰），李大国（王小虎 饰）担心嫉妒，从中作梗。王天来单恋陈艳南，又和赵玉田矛盾不断；长贵（王小宝 饰）一方面想吸引王大拿（赵本山 饰）来村里投资，一方面又怕谢大脚（于月仙 饰）被大拿抢走，他和大脚之间若即若离，忽冷忽热，闹出不少笑话。 矛盾归矛盾，误会归误会，所幸有情人终成眷属，象牙山的青年男女最终得到属于自己的幸福……
